Pseudomonadati
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Pseudomonadati, anteriormente Gracilicutes o Hydrobacteria es un reino de bacterias gramnegativas que presenta gran respaldo en los estudios filogenéticos y que está conformado por los grupos Pseudomonadota, Spirochaetota, PVC, FCB y otros grupos.
Fue inicialmente creado como taxón en 1978 por Gibbons y Murray, editores del Manual de Bergey, para agrupar a las bacterias gram negativas poseedoras de una delgada pared celular, nombrado Gracilicutes proviene de cutes = piel y gracilis = delgado, en alusión a esta delgada pared de mureína. El término Hydrobacteria alude a que este grupo habría evolucionado en el océano, en contraposición a otro supergrupo, Terrabacteria o Bacillati, que evolucionó en hábitat terrestres. En 2024 el grupo fue nombrado Pseudomonadati otorgándole rango de reino.
Características
- La pared celular es típicamente delgada y en ciertos casos se ha perdido.
- Son bacterias gramnegativas debido a que la pared de peptidoglicano no es externa.
- Son didérmicas, es decir, presentan dos membranas celulares , la interna o citoplasmática y la externa que envuelve a la pared bacteriana.
- A diferencia de otras bacterias didérmicas, la membrana externa presenta moléculas grandes y complejas de lipopolisacáridos, cuya porción lipídica actúa como una endotoxina.
- Predominantemente son acuáticas o de medios húmedos.
- Son flagelados, el flagelo bacteriano se inserta en la pared y membranas celulares.
- Son mesófilos o psicrófilos (no son termófilos, salvo pocas excepciones).
- El metabolismo es muy versátil y variado.
- Presencia del inserto proteico Hsp60.
En realidad, todas estas características se presentan también en el filo Cyanobacteriota, por lo que podría haber alguna relación evolutiva, y de acuerdo con R. Gupta formarían un clado, aunque esto no ha sido respaldado dado que las cianobacterias forman parte de Bacillati.
Fusobacteriota estaría en la base del supergrupo Pseudomonadati de acuerdo con la filogenia concatenada de los ARN ribosómicos 16S y 23S, así como lo obtenido con análisis genómicos recientes (2019).
Filogenia
Dentro de la filogenia bacteriana, Pseudomonadati está bien respaldado como un superclado por numerosos estudios basados en el ARNr 16S, 23S, proteínas, enzimas, secuencias de genes, citología y microbiología evolutiva.
Una filogenia algo consensuada en el GTDB database y el Annotree es la siguiente:
| Bacteria |
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Otros análisis filogenéticos especialmente de Cavalier-Smith (2020) han sugerido que Planctobacteria (grupo PVC) es el grupo hermano de Neomura, el clado que incluye a las arqueas y eucariotas, lo que haría que Pseudomonadati sea un taxón parafilético de Neomura. Sin embargo está filogenia no es respaldada por la mayoría de los estudios.
| Cytota |
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Referencias
- ↑ Göker, Markus; Oren, Aharon (22 January 2024). «Valid publication of names of two domains and seven kingdoms of prokaryotes». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 74 (1). doi:10.1099/ijsem.0.006242.
- ↑ Gibbons, N. E. & Murray, R. G. E. 1978. Proposals concerning the higher taxa of bacteria. Int J Syst Bacteriol 28:1–6, (PDF)
- ↑ Gupta RS 2011, Origin of diderm (Gram-negative) bacteria: antibiotic selection pressure rather than endosymbiosis likely led to the evolution of bacterial cells with two membranes. Antonie Van Leeuwenhoek. 2011 Aug;100(2):171-82. doi: 10.1007/s10482-011-9616-8. Epub 2011 Jun 30.
- ↑ Cheryl P. Andam & J. Peter Gogarten 2011. Biased gene transfer in microbial evolution. Figure 1 --| Phylogenetic analysis of bacterial tyrosyl-tRNA synthetase amino acid sequences and the corresponding concatenated 16S–23S ribosomal RNA phylogeny. Nature Reviews Microbiology 9, 543-555 doi:10.1038/nrmicro2593
- ↑ Zhu, Q., Mai, U., Pfeiffer, W. et al. (2019) «Phylogenomics of 10,575 genomes reveals evolutionary proximity between domains Bacteria and Archaea». Nature Communications, 10: 5477
- ↑ Mendler, K; Chen, H; Parks, DH; Hug, LA; Doxey, AC (2019). «AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life». Nucleic Acids Research 47 (9): 4442-4448. PMC 6511854. PMID 31081040. doi:10.1093/nar/gkz246. Archivado desde el original el 23 de abril de 2021. Consultado el 21 de julio de 2021.
- ↑ «GTDB release 05-RS95». Genome Taxonomy Database.
- ↑ Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E-Yung (2020). «Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (eukaryotes, archaebacteria)». Protoplasma 257 (3): 621-753. PMC 7203096. PMID 31900730. doi:10.1007/s00709-019-01442-7.
- ↑ Tom A Williams, Sarah E Heaps, Svetlana Cherlin, Tom MW Nye, Richard J Boys, T Martin Emble (2015). «New substitution models for rooting phylogenetic trees». Royal Society 257 (3): 621-753. PMC 4571574. PMID 26323766. doi:10.1098/rstb.2014.0336.
